В основе развития клинических проявлений заболеваний лежат разные возбудители, найти которые бывает под силу только ПЦР, что и является ее основной задачей иногда совместно с ИФА, а иногда в качестве единственного подтверждающего теста, особенно, если симптоматика заболевания отсутствует.
ПЦР выявляет даже единичные микроорганизмы в исследуемом материале, что позволяет начать лечение на доклинических стадиях заболевания благодаря быстроте проведения анализа (в отличие от классических методов диагностики).
ПЦР-диагностика инфекций относится к категории «золотых стандартов» среди других лабораторных методов, поэтому ее можно применить для поиска возбудителей многих заболеваний, на первый взгляд не имеющих ничего общего между собой: